1. kolo: 9. 8. 2008
Stropkov B - St. Ľubovňa 0:6 (0:2)
2. kolo: 16. 8. 2008
Giraltovce - Stropkov B 2:1 (1:0)
3. kolo: 23. 8. 2008
Stropkov B - Svidník 3:2 (3:1)
4. kolo: 30. 8. 2008
Sabinov - Stropkov B 5:0 (0:0)
5. kolo: 6. 9. 2008
Stropkov B - Bardejov B 1:3 (1:2)
6. kolo: 13. 9. 2008
Kežmarok - Stropkov B 5:0 (5:1)
7. kolo: 20. 9. 2008
Stropkov B - Prešov B 1:4 (1:4)
8. kolo: 27. 9. 2008
Stropkov B - Lipany B 1:5 (1:1)
9. kolo: 4. 10. 2008
Levoča - Stropkov B
10. kolo: 11. 10. 2008
Stropkov B - Vranov
11. kolo: 18.10.2008
Kračúnovce Stropkov .B.
12. kolo: 25. 10. 2008
Stropkov B - Ľubotice
13. kolo: 1. 11. 2008
Humenné B - Stropkov B
14. kolo: 8. 11. 2008
St. Ľubovňa - Stropkov B
15. kolo: 4. 4. 2009
Stropkov B - Giraltovce
16. kolo: 11. 4. 2009
Svidník - Stropkov B
17. kolo: 18. 4. 2009
Stropkov B - Sabinov
18. kolo: 25. 4. 2009
Bardejov B - Stropkov B
19. kolo: 2. 5. 2009
Stropkov B - Kežmarok
20. kolo: 9. 5. 2009
Prešov B - Stropkov B
21. kolo: 16. 5. 2009
Lipany B - Stropkov B
22. kolo: 23. 5. 2009
Stropkov B - Levoča
23. kolo: 30. 5. 2009
Vranov - Stropkov B
24. kolo: 6. 6. 2009
Stropkov B - Kračúnovce
25. kolo: 13. 6. 2009
Ľubotice - Stropkov B
26. kolo: 20. 6. 2009
Stropkov B - Humenné B